Veinte mil años después de la caída de la humanidad, la Tierra sucumbió ante legiones de criaturas voraces que ahora vagan libremente por el planeta. Lejos, en las profundidades del espacio, los últimos miembros sobrevivientes de la humanidad flotan sin rumbo en la misma nave con la que escaparon de la Tierra hace tantos años. Con la nave espacial agotando peligrosamente sus recursos, el consejo directivo de los supervivientes debe decidir su camino a seguir: ¿deben seguir apostando por encontrar otro planeta parecido a la Tierra en el que habitar, o tomarse a pecho un ensayo anónimo que teorice lo que puede ser la única debilidad del “Godzilla”, que obligó a los últimos restos de la humanidad a abandonar su mundo natal? El autor del polémico ensayo es Haruo, un hombre que presenció la muerte de sus padres a Godzilla a una edad temprana, lo que le ha llevado a albergar un odio obsesivo hacia el monstruo. Ahora, encabeza la operación destinada a reclamar el derecho de nacimiento de la humanidad al Rey de los monstruos y matarlo de una vez por todas. Pero, junto con la humanidad, la Tierra ha sufrido un cambio drástico desde su partida; Godzilla y sus numerosas crías pueden palidecer en comparación con la oscuridad que acecha en los corazones de esta comunidad de supervivientes tan unida.
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