El Alzano Empire es el hogar de una de las escuelas de magia más distinguidas del mundo: la Academia de Magia Imperial de Alzano. Aquí, los jóvenes estudiantes ambiciosos se entrenan para convertirse en magos competentes. Sistine Fibel, una chica noble severa, y su mejor amiga Rumia Tingel de ojos brillantes asisten a la Academia, decididas a cultivar sus habilidades mágicas. Sin embargo, su mundo se lanza a un bucle cuando su maestro favorito se retira repentinamente y el enigmático Glenn Radars lo reemplaza. Su actitud perezosa e indiferente hacia la vida y la magia lo pone rápidamente en desacuerdo con su clase. Lo que es más, las fuerzas infames ocultas dentro de los muros del imperio comienzan a activarse, y Sistine, Rumia y Glenn se encuentran atrapados en sus planes. Rokudenashi Majutsu Koushi a Akashic Records sigue a Sistine, que está cautivada por un misterioso Castillo del Cielo flotante; Rumia, que está obsesionada por un pasado problemático; y Glenn, que puede ser más de lo que parece. Aunque son completamente diferentes en la superficie, están inexplicablemente unidos por un hilo del destino.
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